Ancien siège d'un prieuré clunisien, Pontoux possède une église reconstruite en 1773 avec un beau pavement de terre cuite du XVIII^e siècle. Le village compte aussi un château à tour crénelée du XVII^e siècle (privé) et quelques jolies maisons bressanes.

Le bois de Pontoux est propice à la randonnée pédestre et les amateurs de pêche trouveront leur bonheur dans le Doubs, avec la mise à l'eau pour les bateaux.

Un jardin botanique-roseraie (privé) se visite sur rendez-vous (06 77 68 59 37).