Situé au confluent du Doubs et de la Guyotte, Navilly compte 414 habitants qui sont installés sur ses terres depuis les temps préhistoriques. Célèbre pour ses ponts de pierre construits par E. GAUTHEY
Deux ponts du XVIIIe siècle construits par Emiland Gauthey enjambent respectivement la Guyotte et le Doubs sur la route nationale 73. L'un de ces deux ponts, situé sur le Doubs, est classé monument historique. Le pont de la Guyotte ne comporte qu'une arche. (Il est situé juste à côté de l'église.) Le pont du Doubs est constitué de 5 arches. Le pont classé monument historique a été construit au 18e siècle (1782-1790).C’est le pont le plus important d’Emiland Gauthey car il possède une longueur de 156m. On a utilisé deux pierres de couleurs différentes : l’une rosée issue d’une carrière proche de Dole et l’autre blanche provenant de Franche Comté Durant la Seconde Guerre Mondiale, le Doubs servait de ligne de démarcation à Navilly, qui se trouvait de ce fait en zone libre. Le pont fut partiellement détruit, puis, reconstruit après la guerre.
Le Doubs et la Guyotte : ces deux rivières font le bonheur des pêcheurs.
L'église fut construite au XIX° et est placée sous le vocable de l'Assomption de la Vierge. Cet édifice de style néo gothique abrite cinq bustes en bois et deux tableaux.
Chapelle St Léger: monument du XIe siècle qui a été restaurée en 1975.
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